元々、幼稚園の頃から頭痛が酷く、痛み止めもほとんど毎日服用していますが、カメレオンスティックを使い始めて、後頭部の左あたりにも痛みが出始めました。

お会いできたので総合的なお身体の状態の聞き取りや、触診ができたので分かりましたが、幼少の頃から首と腰の歪みが大きいようです。
こういった場合は、スティックにより頭部の歪みが矯正されてくると、歪みの大きかった首と腰の歪みも、歪みの少ない方より大きく反応してきて本来の位置に戻ろうとしてきます。その過程で、筋肉の弛緩収縮バランス（縮んでいた筋肉が緩んだり、緩んでいた筋肉が縮んだり）が急激に調整されるので、一時的にどこかに痛みや筋肉痛のような症状、のぼせなどが出ることがあります。
後頭部の左ですが、ここは骨盤の腸骨左から生えている筋肉がつながっている場所なので、互いに引っ張りあって反応していると考えられます。
このように、元々の歪みが大きい場合には一気に全身の骨が動き始めて、その過程でさまざまな反応（好転反応）が出ますので、しばらく様子を見ていただき、また痛みが強い時には相談くださいませ。