L2ネットワーク内に他で管理しているWiNGコントローラーいると新規にネットワークへ追加したAPが意図しないWiNGコントローラー配下にアダプションされてしまいます。

WiNGコントローラーはMINTプロトコルで新しいAPの追加を検出しますので、新規追加APを独立して管理したい場合はAP側設定でMINTプロトコルを遮断してください。
方法は以下となります。
APのEnterprise UI画面から以下を開き、
Configuration -> Device -> Device Overrides -> AP7522-XXXXXX -> Advanced -> MINT Protocol -> Settings -> MINT Link settings
MLCP VLANのチェックを外す。

EXT0032