水質が変わるシャワーヘッドを付け替えたいと考えた場合、日本製のシャワーヘッドに付け替え可能でしょうか？

シャワーヘッドにつきましては日本製ではない可能性が高いです。
※一応マレーシアのお店なので必ずしも日本製が置いてあるとは限りません。
一応、マレーシアにもドン・キホーテはありますが、シャワーヘッドが置いてあるかどうかは分かり兼ねます。

型によると思いますが、一応マレーシアにもMrDIY(というお店)でシャワーヘッドを売っているとのことでした。
現地へ到着されてからサイズなどを確認しつつご購入することをオススメします。