モシコムのシステムを利用して参加費を集める場合、以下の2種類の手数料が発生します。
①エントリー手数料
申し込み料金（※注） ～4,000円： 手数料212円
申し込み料金（※注） 4,001円～： 手数料5.3%（税込）
②システム利用料
申し込み1人につきシステム利用料110円（税込）
通常、①はユーザー負担、②は主催者負担として徴収されますが、これらを「主催者が払うか」「参加者に上乗せして払ってもらうか」を、主催者が自由に選べます。
負担パターンについて（5,000円チケットの場合）
設定によって、最終的な金額が以下のように変わります。
A：すべて参加者が負担するパターン
【参加者が支払う金額】
5,375円(5,000円 + ①エントリー手数料265円＋②システム利用料110円)
【主催者が受け取る金額】
5,000円
B：手数料を折半するパターン
【参加者が支払う金額】
5,265円(5,000円 +①エントリー手数料265円)
【主催者が受け取る金額】
4,890円(5,000円 - ②システム利用料110円)
C：すべて主催者が負担するパターン
【参加者が支払う金額】
5,000円
【主催者が受け取る金額】
4,625円(5,000円 - ①エントリー手数料265円‐②システム利用料110円)