特定輸送事業者とは、自らの事業活動に伴って、他人又は自らの貨物を輸送している者及び旅客を輸送している者のうち、輸送区分ごとに保有する輸送能力が、一定基準以上である者を、国土交通大臣が特定輸送事業者として指定するもので、特定荷主とは異なります。
下記の国土交通省HPにてご確認ください。
https://www.mlit.go.jp/sogoseisaku/environment/sosei_environment_tk_000002.html