事業実施主体として単独の農業法人は対象でしょうか。

農業法人は、単独でも応募主体として、ご応募可能です。
「公募要領」のP9 の別表1、6番の「民間団体」（注1参照）に該当するため、人数の要件を満たしている場合、対象となります。