学習漫画を読むことは、決して悪いことではありません。
漫画を読むことも読書の1つであり、本を開くという行為自体に対するハードルを下げる手段になります。
また、お子さんが漫画を読まれている時に
* 〇〇ちゃん/〇〇くんは本が好きなんだね
* 本って面白いね
と声をかけてみてあげてください。
漫画を読んでいる状態を本を読んでいる状態として肯定し、それを本が好きだと表現することで、お子さんはじわじわと漫画以外の本も手に取るようになります。