pixivFANBOXでの支援者限定で公開するデザインも商用利用になるでしょうか？

支援者限定で公開・配布するもの、たとえばカレンダー壁紙などは、商用利用になります。

企画配信の振り返り記事として、ロゴやサムネイルを載せるなど、デザインを再利用することは問題ございません。こちらは商用利用の範囲にはなりません。