【教職】　必要単位を全て履修し終わった後、どのように免許申請すればよいですか。

個人申請となるので、必要単位を修得した段階で免許申請が可能です。
申請先は、現職の教員は勤務校が所在する都道府県教育委員会、それ以外の人は現住所のある都道府県教育委員会です。
免許申請の受付期間や提出物は都道府県ごとに異なりますので、各教育委員会Webサイトを確認してください。