これから2023年の症例をJESGOに入力して、2024年6月の腫瘍登録に一括登録することは可能ですか？

可能です。
例えば2023年と2024年の症例では登録要項が異なりますが、JESGOでは初回治療開始日をもとに入力欄が切り替わる仕様となっています。