キャリア決済のお支払いを登録し直すと、これまでの会員情報はどうなりますか？最初からの入会扱いになってしまいますか？

いいえ、新規入会扱いにはなりません。
メールアドレスと生年月日を使って引き継ぎ手続きを行うことで、これまでの会員情報が引き継がれます。お支払い方法を改めてご登録いただいても、新規入会扱いにはなりません。