所轄庁への報告書は郵送できますか？

郵送可能です。

千葉県（千葉市以外に主たる事務所のあるNPO法人）では、事業報告書等を2020年（令和2年）4月1日からインターネット「ちば電子申請サービス」からもできるようになりました。

出典：千葉県・ちば電子申請サービスを利用した事業報告書の提出について
https://www.pref.chiba.lg.jp/kkbunka/npo/houjin/densisinseisystem.html