会議の議事録は、同じ社内でも他部署の人に閲覧されたくありません。なにか設定が必要ですか？

いえ、特別な設定は必要ありません。
システム仕様上、議事録を閲覧（編集・ダウンロードも可）できるのは、ZMEETING会議オーナーとZMEETINGの当該会議に登録されている参加者のみとなります。