年末調整をせず自分で確定申告を行っても良いですか？

申告が複雑であることからできれば年末調整をされることをお勧めします。会社で年末調整を行わない場合は必ず「確定申告」を行ってください。（個別に確定申告が必要な場合は必要に応じお願いいたします）
但し、ご自身で確定申告をされる場合でも、扶養控除申告書は提出いただきたいため、各種申請無で一旦申請してください。