口座振替とPaidどちらから請求されますか

口座振替が優先です。

口座振替の登録が完了していない、口座残高不足など口座振替ができなかった場合はPaidでの請求となります。

Paidは請求額の3%を手数料として上乗せし、請求いたします。
以後切り替えをしない限りはPaidで請求され続けます。