免税データ送信後に表示されるQRコードをお客様のスマホでスキャンしていただくことは必須ですか？

いいえ。必須ではありません。
QRコードには、今回の免税データの詳細（パスポート情報/購入内容　等）が含まれていますので、お客様のご希望があれば、QRコードを保存していただくことで、レシートの代用データとしていただくことが可能です。