個々の作成済み.shaiファイルを引用する場合は、「作成済データ引用」ボタンで取り込んでください。
まず、複数の依頼製品名が記載された依頼ファイルを開いて、基本情報画面にある依頼製品の1つをチェックした後に「作成済データ引用」ボタンを押下し、該当する作成済みshaiファイルを1つずつ取り込んでください。
追記:クイックマニュアルも参照してください。
https://chemsherpa.net/docs/description#document