特定事業者が保有する「未指定工場（指定を受けていない工場）」に1,000㎡以上の屋根がある場合、定期報告書に記載しますか。 [ID_P-8013]

いいえ、記載義務はありません（任意です）。
定期報告書における詳細報告は、あくまで「エネルギー管理指定工場等」に該当する事業所が対象です。指定を受けていない未指定工場については1,000m2未満、1,000m2以上のいずれも報告対象外で、任意の報告となります。