字下げについて、オートフォーマットでの字下げが反映されている場合が考えられます。
Word上の見た目で、行頭1字空きがあってもオートフォーマットによる字下げは変換時に反映されません。
制作しやすくするために、文章校正：「オートコレクトのオプション」の設定を行って下さい。
https://romancer.voyager.co.jp/how2makebymsword/
行頭1字空きを行う場合は、スタイルで設定するか、各行頭にスペースをいれてください。
行頭にスペースを入れた場合、□が表示されていれば問題ありません。
行頭でスペースを打ち込んでも、□が表示されない場合はコピー&ペーストでスペース記号（Word上で□のように表示されます）を貼り付けることを推奨します。