日本ジオトラスト株式会社と21-domain.comのホームページのSSL提供価格が違いますが、異なるサービスですか？

いいえ、21-domain.comは日本ジオトラスト株式会社の正規代理店につき日本ジオトラスト株式会社のホームページでお申込いただけるサービスと同一です。
価格は21-domain.comではかなり格安で16,800円〜となっています。
詳細は21-domain.comのホームページをご覧下さい。