Phase1以降もストレッチは続けていいですか？

続けて大丈夫です。
血液の循環が良くなり続けます。
血液の循環が全身に行き渡ることにより細胞の修復ができますので、健康的に生きるための絶対条件です。

また、血液の循環が良くなるということは代謝が上がることにも繋がります。
痩せやすい体を作るためにストレッチは効果的です。