ベルハンマーで被膜を作ったあとに一般的な潤滑油を使用すると、ベルハンマーの効果は打ち消されてしまうのでしょうか？ また、最初にベルハンマーを使用し、その後は通常のオイルでメンテナンスする方法は可能ですか？

ベルハンマーは摩擦によって金属表面に潤滑被膜を形成する構造のため、一度形成された被膜は通常の潤滑油を上から塗布してもすぐに失われることはありません。

農機具のようにメンテナンス頻度が限られる場合は、
・初回にベルハンマーを塗布し、被膜をしっかり形成させる
・その後は通常のオイルで軽い潤滑メンテナンスを行い、動きが重くなってきた段階で再度ベルハンマーを使用する

という使い方がおすすめです。
被膜の耐久期間は使用条件によって異なりますが、一般的な潤滑油より長く効果を保持します。