湿式バイクのエンジン組み込みオイルとしてモリブデン系のオイルの代わりに、ベルハンマーを使用しても問題ないですか？

問題なくご使用できます。
クランクやピストンの組み込みオイルとして使用し、エンジン始動前になるべく多めにクランキングすることで
エンジンの焼き付き防止やクランクやシリンダーの延命や出力アップに繋がります。